Av hennes iscensättningar under de senaste åren kan nämnas Ivar Hallströms opera Hertig Magnus och sjöjungfrun på Vadstena-Akademien 2000, Rossinis Askungen på Värmlandsoperan 2002, Mio min Mio på Stockholms Stadsteater 2002, Roald Dahl-föreställningen Vedervärdiga verser på Unga Riks 2003 samt Ronja Rövardotter på Stockholms Stadsteater 2004. I februari 2005 hade hon premiär på Mozarts Enleveringen ur seraljen på GöteborgsOperan.
Stina Ancker arbetar också med radioteater och har bland annat gjort Änglar i Amerikaav Tony Kushner och Alice i Underlandet. Hon är dessutom lärare i scenframställning vid Operahögskolan i Stockholm samt medlem i Vadstena-Akademiens konstnärliga råd.